2) 蛋白-蛋白和蛋白-核酸相互作用：主要使用X-射线晶体衍射技术对基因表达调控中关键的蛋白-蛋白和蛋白-核酸相互作用进行结构表征。对于难以结晶的生物大分子复合物，使用X-射线小角散射结合分子动力学模拟方法获得其结构信息。目前研究体系包括：大肠杆菌RNA分子伴侣Hfq及其与RNA相互作用；tRNA甲基转移酶Trm10与tRNA的相互识别机制等。