发现真核生物中无内含子的基因含有一些顺式作用的RNA序列元素，通过“绑架”细胞内正常基因表达和加工的所需因子，提高无内含子基因mRNA的稳定性，poly(A)聚腺苷酸化，以及从细胞核到细胞质的运输(NAR 2005; MCB 2005)。确认了高等动物中存在着细胞核里的基因干扰现象；发现了siRNA从细胞质转运到细胞核的途径；发现和解析了nrde 通路；发现细胞核RNA干扰可以抑制RNA聚合酶II的转录延伸，造成转录的提前终止；发现高等动物中siRNA造成组蛋白的H3K9me3和H3K27me3甲基化(Science, 2008；Nature, 2010；PLoS Genetics，2011；Genetics, 2014；Curr. Biol., 2015)；发现细胞核和细胞质RNAi干扰通路都参与了生物体获得性性状的多代遗传(Nature Genetics，2012；Cell Reports, 2018）；发现了核仁RNA 干扰，发现了一类受环境刺激调控的针对rRNA的小干扰RNA(risiRNA)和抑制risiRNA产生的Susi通路，发现了一种新的rRNA稳态调节机制(Nat Struct Mol Biol, 2017；PNAS, 2018；Nucleic Acids Research, 2021a)；发现和解析了介导piRNA转录起始的USTC复合物和帮助piRNA转录后加工的PICS复合物(Genes & Development, 2019；Cell Reports, 2019；PNAS, 2021；Nature Communications, 2021；JGG, 2022)；发展了基因编辑的新方法 (Sci. Rep., 2014；Genetics,2015; G3, 2018）。