任何细胞都能对其外界环境的改变作出反应，这是生命现象的基础，而这个信号处理过程是由细胞内的信号网络完成的。 当代生物物理的一个重大挑战就是理解这些信号网络的工作机制。 为迎接这个挑战，我们结合各种实验和理论手段去寻找一些普遍原理，来解释信号网络的不同架构怎么产生复杂的细胞行为。

以细菌行为为例，我们结合各种光学手段（全内反射荧光TIRF、荧光共振能量转移FRET、 激光暗场Laser darkfield、超分辨技术Super-resolution techniques、光镊Optical tweezer）、微流体技术、及分子生物学技术，以及统计物理模型， 从分子马达到信号传导网络水平上研究分子与细胞行为。

我们以细菌趋化(chemotaxis)网络和c-di-GMP网络为例，来研究细胞信号网络。对这两种网络的研究不仅有基础科学上的意义，也有应用前景。 细菌的运动及趋化(chemotaxis)行为是细菌致病的必要条件之一， 对其深入系统的研究有助于开发新的治疗药物。对鞭毛马达的系统研究也有助于将来人造纳米马达的开发和研制。 而c-di-GMP网络参与调节细菌的多种关键生理功能, 包括细胞分化、微生物膜（biofilm）形成、致病因子产生等，对其研究有助于开发新的抗生素。